ELSŐ SZEZON

1. Muunilinst-i küldetés

A klón háborúk zajlanak galaxis szerte. Ennek megfékezésére klónseregek vannak. Történt úgy, hogy megtudták a jedik, hogy a Bankár klán hatalmas droid gyárat rejteget. Egy klónsereg odaindul, amikor eldõl, hogy ki vezesse a sereget, Palpatine Anakint mondja, hogy õ legyen a klónsereg parancsnoka, de végül mester és padawan megy.

Megérkeznek a bolygóra, látják, hogy már számítottak rájuk, droidok támadnak sokfele. Obi-Wan kiadja az utasítást és a klónok elmennek, Kenobi lemegy harcolni, a hajó pedig tovább megy. Egy rohamdroid nyomkövetõ rakétát lõtt a hajóra és zuhanni kezdenek. Szerencsére minden klón túlélte a becsapódást, de lõni kezdenek rájuk...

3. Városi háború

Miután a klónkatonák egy hajója lezuhant, gyalog kellett megtenni az utat, a becélzott seregvezetõt végül nem találták el a rohamdroidok, a klónsereg lõtte le õt. A csapatmunka sikerrel járt akkor is, amikor egy droidok vezérelte hajó a klónokra lõtt, mert egy klón bement a hajóba és megsemmisítette a vezetõket.

4. Durge bejövetele

Anakin a rész kezdetén sorra lövi az ellenség hajóit, nem hiába, hisz a baljós árnyakban már bizonyította repülési tudását. A klónkatonák halomra lövik a droidokat és épületeket, de eközben titkos megbeszélés folyik és felbukkan Durge. Az õ serege elindul a robogókon és sok klónt tarolnak le, emellett jármûveket is...

5. Kit Fisto, vizes és vad

Amikor a szeparatisták megszállják a Mon Calamari-t, a jediknek és a klónoknak cselekedniük kell, ezért Yoda parancsot ad Kit Fistonak, hogy egy vízalatti klónsereggel pusztítsa el a szeparatisták vízalatti bázisukat, de a jedi még nem sejti, hogy milyen óriás robot vár rá. Nehezen, de a robotot egy erõlökéssel elpusztítja.

Az egész úgy kezdõdik, hogy gladiátormérkõzés van és két szörny harcol egymás ellen, késõbb már nem csak szörnyek harcolnak. Dooku megérkezik, és beül a kilátóba nézni a meccset, de késõbb felbukkan egy ismeretlen lény, akirõl késõbb kiderül hogy sith és azt is megtudhatjuk, hogy a neve Asajj Ventress...

Miután végetért a gladiátor mérkõzés Ventress gyõzelmével, Dooku villámokat szór rá. Asajj egy új helyen ébred, fel akarja venni a lézerkardját, de Dooku rátámad, õ felugrik és magához húzza a kardokat. Kemény harc után Dooku gyõz, de Asajj Ventress végül kap két sith kardot és a jedikhez indul...

8. Jedi katona

Durge és droidserege sok pusztítást végez a klónkatonáknál, de ekkor felbukkan egy új osztag, a speederes klónkatonák egy rejtélyes parancsnok vezetésével. Az ütközetnél csak Durge és a klónkatonák parancsnoka marad, mint késõbb kiderül, Obi-Wan az. Sok harc után Kenobi gyõz, de Durge még vissza fog térni...

Obi-Wan megy a célhoz a robogójával, aztán bravúrosan megékezik a klónkatonákhoz. A klónok betörnek a droidgyárba, de nem megy simán az akció, mert megjön Durge! A katonák próbálják lõni, de õ visszaegyesül. Kenobi támad a szörnyre végül nehezen, de legyõzi, ám Durge most is kezd visszaalakulni...

10. Anakin harca

A részben Anakint láthatjuk végig, ahogy több száz ellenséges vadászt legyõz logikával és taktikával. Ám, amikor sok vadász követi, megkéri az oldalán állókat, hogy löjjék oda az összes rakétát, hogy meghaljanak. Ez sikerül és amikor teljesül a fõ céljuk, egy új ellenség lép színre, aki az összes oldal állót letarolja...

MÁSODIK SZEZON

11. Üldözésben

A 10. részben abbamaradt pilótaharc Anakin Skywalker és Asajj Ventress között folytatódik. Az üldözés során Anakin elhalad mestere és egysége felett, Obi-Wan vissza próbálja hívni, hogy ne menjen a gép után, mert csapda, de Anakin nem hallgat rá, elkezdi üldözni a hiperűrön át, mestere parancsának ellenére...

Ebben a részben szerepel Mace Windu először. Innen meg lehet tudni, hogy milyen nagyszerű harcos és hogyan bánik az erővel. De egyszer csak megjelenik egy új gépezet, ami több száz klónkatonát megöl egyszerre. Mace Windu az egyik ilyen hullámban elveszti a kardját és sok droid állja körül és egyedül van.

13. Fegyvertelen Mace

A rész ott folytatódik, az előző folytatása, Mace Windu ott áll sokszáz droiddal körbevéve. Kénytelen erővel harcolni a gépek ellen. Szinte a fél droidsereget elpusztítja, ám a hatalmas gép még egy földrengést idéz elő, amiben Mace egy hatalmasat repül, de közben meglesz a kardja. Ezután futás erővel ráugrik a gépre és elpusztítja azt.

14. Ilum megtámadása

Egy jedi mester és tanítványa (aki addigra már kitanulta az erőt) rakja össze a volt tanítvány új lézerkardját. Ott vannak, ahol a kardba való kristályok vannak, ezért nem nehéz így. Ám ez sem lehet zavartalan, ugyanis ellenséges droidok bombákat helyeznek el a barlangba, a két jedi védekezik, de ez kevés, a hely rájuk omlik, erővel üzennek Yodának...

16. Jedi kimentés

Mivel Yoda még nem érkezett vissza, Padmé is elindul a jedik keresésére. Sok droid áll az újtába, de nagynehezen legyőzi őket kisebb-nagyobb trükkökkel, mint például, amikor C3PO-t teszi ki célpontnak, csak azért, hogy lelőhesse a láthatatlanná vált droidokat. Végül Yoda megérkezik a két jedivel és visszamennek a hajóhoz...

17. Baj a Yavin IV-n

Anakin a Yavin 4-ig követte Ventresst, ahol leszállt, így hát ő is. Mikor elindult, hallott egy nagy lövést a háta mögül, visszament és látta, hogy az Obi-Wan által küldött katonák megjöttek, Anakin kiadta a parancsot nekik és ő is elindult egy klónnal. Asajj erővel dobálta a klónokat, a végén csak Skywalker maradt, akivel fénykardot rántottak...

18. Anakin vs. Asajj

Elkezdődött a Clone Wars sorozat legnagyobb harca, Anakin és Asajj párbaja. Nem csak egyszerű párbaj volt ez, hanem erőpróba is, mert keresztül-kasul ugráltak fáról-fára, közbe egyet mindketten csaptak a kardjukkal. Elkezdett esni az eső és látszott a kardokon a nyoma, ezután mindketten vártak a másik kezdésére...

19. Egy kiterjedt párbaj

A harc folytatódik, itt is folyton változtatják a helyüket, és már bővebben használnak erőt is. Amikor a tetőre értek Anakinnak kiveri Asajj a kezéből a fénykardját, de Anakin lefogja Ventress mindkét kezét és az egyiket úgy megszorítja, hogy elejti a vörösen izzó kardját, persze ezt Anakin látványosan magához veszi és pár súlytással legyőzi ellenfelét.

20. Grievous támad!

A félelmetes Grievous tábornok első bemutatkozása. Pár Jedit, köztük Ki-Adi Mundit és Shaak Ti-t bekerítenek szeparatista droidok és a vezetőjük, Grievous. Nagy harc árán sem tudnak elbánni vele, ám Ki-Adi megpróbálja a lehetetlent, a tábornokot legyőzni. Épp felé ugrik, mikor vége a résznek.

HARMADIK SZEZON

A klónok éppen felkészülnek egy mentőakcióra, hogy kijutassák a túlélőket Grievous kezei közül. Miután túljutottak a droidseregen betörnek az összeomlott építménybe. A klónok kiugranak és a csapat vezetője mindenkinek kiadja az utasításokat. Ezután a hajó felemelkedik és a klónok felé tartó droidsereget kezdi el lőni. A klónok rátalálnak Ki-Adi Mundira és Grievousra, a jedi éppen elejti a kardját, amikor megjön a segítség. A klónok elkezdik lőni a droid tábornokot, de ő mindig elfut a lövések elől. Grievous menekülésének vége, leugrik a klónok elé és levág párat kék és zöld fénykardjával. A klónok nem bírnának vele, ezért betör a csapatszállító. Grievous elmenekül és a klónok is. Csak Ki-Adi Mundi, Aayla Secura és Shaak Ti élte túl a csatát. Miután Ki-Adi elszörnyed azon, hogy csak hárman maradtak meg, megszemlélhetjük az egyik jedi lehulott fejét és a kardját is, amit Grievous éppen elvesz tőle. A klónok elmentek és Anakint látjuk, amint Qui-Gonnal beszél a Dagobah, a titokzatos barlang előtt, aztán Anakin elkezd bemenni. Ezután megtudjuk, hogy Yoda látomását láttuk. Ki-Adi felszólal a Jedi Tanácsban a mészárlásról. Ezután minden tanácstag egyetért abban, hogy több Jedi Lovag kell. Obi-Wan megemlíti, hogy a tanítványának, Anakinnak rangot kéne lépnie. Miután ez megtörtént, Anakint láthatjuk, aki a tömegben sétál, aztán odalép egy üveghez és nézi a körülötte lévő lényeeket. Ezután felbukkan egy fekete csuklyás alak. Anakin rájön, hogy követik és elfut. Aztán meglátja azt, aki követte és behúzza a sötétbe, a kardját pedig kinyitja. A titokzatos személy megszólal, és Anakin rájön, hogy ő Padmé. Ezután csókkal üdvözlik egymást. Anakinnak elege van abból, hogy ő csak padawan, pedig az ereje felülmúlta már ezt. Megszólal egy ismerős hang, C-3PO-é, aki Padmét keresi. Anakin őt is berántja erre a sötét helyre. A droid már megkapta az arany lakkozást. Hirtelen hívás érkezik Obi-Wantól, és Anakinnak azonnal el kell mennie. Anakin késve érkezik és Obi-Wan elbeszélget vele. Egy ajtó kinyílik. Anakin besétál és Obi-Wan is mögötte. Minden tanácstag kinyítja a fénykardját, Anakin örül, mivel már tudja mi fog történni. A Tanács tagjai lefelé tartják a kardjukat, Anakin közelebb lép Yodához és letérdel. Yoda elmondja a ranglépési szöveget. Majd így fejezi be: "A köztársaság Jedi..." - közbe levágja Anakin tincsét - "Lovagja". Anakin feláll. Majd C-3PO viszi el Padménak a fiú tincsét, amit betesz a japorfa medél mellé. R2-D2 is hoz egy üzenetet Padmétól Anakinnak. Majd a hajójával felszáll.

Egy tábornokot látunk, amit éppen beszél, aztán az egyik rohamdroid jediket észlel. A tábornok rákérdez hányat és megdöbben, amikor azt a választ hallja, hogy kettőt. Ezek a Jedik nem mások, mint Obi-Wan Kenobi és Anakin Skywalker. Az égen hajók jelennek meg, Obi-Wan és Anakin pedig a droidokat vágja le. Itt már Anakinnak hosszú haja van és van egy sebe is. Ezután az egyik Jedi Mestert látjuk, amint a csillagvadászát üldözi két Tri-fighter, de Anakin segít neki. Aztán 3 Jedi bajba kerül, de Anakin megmenti őket. Egy hajó száll le, Anakin hajója, éppen Padméhoz megy, de a lány elcsodálkozik, hogy így megváltozott. Obi-Wan a szabadban próbál aludni, Anakin megérkezik és hozza az ebédet bogarak formájában. A bogarak tárolója egy térkép volt. Ezután elindul Anakin és Obi-Wan ebbe az épületbe. Egy generátort látnak és egy csomó rohamdroidot. Obi-Wan robbanó golyókat vesz elő és szétszórja. Majd kikapcsolnak egy védőpajzsot, azét a létesítményét, amit a klónok nem tudtak megtámadni. Újabb képváltás, a Kashyyykon járunk és két wookie vadászik, majd hirtelen megjelennek a szeparatista erők. Majd jópár bolygón még láthatjuk, hogyan foglálják el azokat. A kép most Dooku és Grievous párbajára vált, de kiderül, hogy ez csak edzés és Dooku tanítja Grievoust. Beszélnek és Palpatine hologramja megjelenik és elmondja a tervet. A kép átvált Obi-Wanhoz és Anakinhoz, akik épp kapnak egy hologram hívást Windutól és Palpatinetól. A két Jedi egy jeges bolygóra utazik klónok társaságában, majd Anakin megöl egy nagy kék állatot, amiről Obi-Wan már nem tudja lebeszélni. Majd egy pár érdekes maszkos lény megjelenik és érdekes módon az eredeti angol verzióban(!) elkezd az egyikük magyarul beszélni.

Yoda éppen meditál, mikor megérez valamit és kinéz az ablakon, látja, hogy a várost megtámadták. Mace Windu befut Yodához közölni a hírt és Yoda kiadja a parancsot. Mace Windu beszélget egy másik mesterrel, azután beszáll a gépébe, aztán felszállnak. Ezután Obi-Wanékhoz vált a kép, akik éppen mennek egy törzs falujába. Egy kunyhóba mennek be, ahol elmondják a híreket a törzs legidősebb tagjának. Aztán az öreg törzsfőnök meg akarja beszélni a Nagetus Spiritussal a történteket. A kép Coruscantra vált, ahol zajlik a háború. Felbukkan C-3PO, és a már terhes Padmé is, amikor egy épület falát kilövik. Mace Windut láthatjuk, amint lövi az ellenséges képeket, aztán Tri-fighterek veszik üldözőbe, de lerázza őket. Hirtelen több raj droidvadászba csapódik és ki kell ugrania, de elkap egy másik droidvadászt és azt irányítja. Mikor a többi gép megérkezik az űrbe, hatalmas harcot láthatunk és éppen elveszt a Köztársaság egy hajót, amikor átugranak egy ellenségesre és azt foglalják el a klónok egy Jedi Mester vezetésével. Újra az ismeretlen bolygót látjuk, a tűz körül ülnek a törzs tagjai, Obi-Wan és Anakin. A tűz füstjéből egy kéz jelenik meg (és a hivatalos angol verzióban is azt mondja a törzsfőnök, hogy "Volt kezed"), Obi-Wan ránéz Anakin robot karjára és felemeli a magasba. Újra a klónháborúban vagyunk, Coruscanton, és Yodát látjuk éppen harcolni az Erő segítségével. Aztán a Jedi Mester hall egy segélyhívást és odasiet. Képváltás, újra az ismeretlen bolygón vagyunk, az öreg törzsfőnök épp piócákat dob Anakin testére, akik jelekkel látják el. Ezután Anakin egy nagy állatra pattan, amit közlekedésre használnak és elindul. Végül megint Coruscantot látjuk, ahol a klónok az egyik frontot már nem bírják tartani, de Yoda megérkezik és segít nekik. Rövid idő múlva Windu is csatlakozik az itteni harchoz. A harc közepén elkapcsol a kép és Palpatine főkancellár kávéját láthatjuk, amint megrezzen a háborúk miatt. Az irodájába Jedik rohannak be, mert szerintük veszélyben van. Hirtelen dobogások hallatszanak, és Shaak Ti rájön mi is ez. Aztán Grievous, a droid tábornok behéz felülről az ablakon és betöri azt...

Grievous Palpatine irodájában van néhány Jedivel és a főkancellárral. Palpatine elkezdi leszidni Grievoust, amiért csak úgy betört az irodájába. A droid meg akarja fogni Palpatinet, de Shaak Ti magához rántja az Erővel és elkezd Palpatine menekülni a Jedikkel, közbe pár testőr és klónkatona Grievoust próbálja megfékezni. A Jedik a lifthez rohannak, de a droid tábornok utánuk megy. Szerencsére az Erővel le tudják lassítani. A lift elindul, hirtelen feltűnik Grievous, amint mellettük fut a falon. A Jedikkel tartó klón kilövi a droidot, de csak egy időre. Mikor leérnek droidok fogadják őket és Grievous is újra feltűnik, ezért menekülniük kell. Miközben futnak, feltűnik Grievous két testőre, akiket sikeresen átugornak, de a klónokat megölik. A kép átvált az előző részben megismert bolygóra, ahol Anakint látjuk. Skywalker bemászik egy barlangba, ahol mérkező füst tőr elő a felszínről és azt kell kerülgetnie. A sziklán egy történetet fedez fel és ahogy nézi, egyre jobban érti. Egy ember történetét látja, aki megmentette a népét a gonosztól, de elveszítette a kezét és újat kapott helyette. Ezután minden ellenséget legyőzött, de egy nap a kéz hatalmába kerítette és mindenkit elpusztított a környezetéből. A történet végén Padmé kiáltását halljuk, és Anakinért kiált. Anakin leesik a földre, felpillant és egy szeparatista gyárat lát meg. A kép újra Coruscanton, a Jediket üldözi Grievous két testőre. Sok helyszínen át menekülnek Palpatinék és végül a metróban kötnek ki. Kemény harc után Shaak Ti levág egy testőrt és egy másikat a metró alá lök. Még egy testőr maradt, amit egy másik Jedi intéz el. Végül Palpatine főkancellár és védelmezői elmenekülnek, de Grievous felbukkan újra. Mikor már Grievous le akarja vágni Shaak Ti-t, a Jedi ráköti észrevétlenül egy induló metróra a köpenyét és az elhúzza, így megmenekülnek. A képen újra Anakin tűnik fel, aki épp besurran a gyárba. Mikor megérkezett, látja hogy milyen kísérletek zajlanak ott és megpróbálja leállítani...

Coruscanton járunk, a harc zajlik javában, míg Yoda és Mace Windu újra megmutatja vívási tudományát. Közben rájönnek, hogy az egész háború elterelés és Palpatine főkancellárt akarják elrabolni. A kép átkapcsol a Jedikhez, akik Palpatine-nal menekülnek, de a kivezető kabinba Shaak Ti nem száll be, ő marad és megfékezi Grievous testőreit, körülbelül 9-et, vagy többet. Közbe az ismeretlen bolygón járunk, ahol Anakin ki akarja szabadítani a génmódosított fajt, de ellene fordulnak. A fajból egy valaki még átváltoztatás alatt van. Anakin közbe elkezdi megfékezni őket, de az az egy kitör az üvegből és letépi a tudatmódosító láncokat a társairól. Anakin ezútán segít neki és felszabadítják őket. A kép újra Coruscanton, a kabinnal menekülnek Palpatine védelmezői és maga a főkancellár miközben Shaak Ti a testőrökkel küzd. A Jedi elejti a kardját, de sikeresen védi így is a támadásokat és a testőrök fegyverével védekezik tovább. Közbe újra Anakint látjuk aki a droidokat öli, hogy eljusson a generátorhoz, közben az a bizonyos faj is segít neki, akiket kiszabadított. A generátor fő magját, egy kristályt erőmező vesz körül, ezért a robot kezével nyúl be érte, ami hihetetlen fájdalmat okoz. El tudja törni a kristályt, de a keze is ugyanerre a sorsra jut a pajzs nyomása miatt. A bolygó felszabadult, a szeparatisták pedig szöknek, de Anakin megállítja őket a letört robot kezével és az Erő segítségével. Az utolsót, aki meg akarja ölni, ő öli meg előbb. Itt láthatjuk Anakin gonosz felét. A nép és velük lévő Obi-Wan látja, amint visszatérnek a társaik, de elszörnyednek, amikor látják hogy. Egy kisgyerek oda fut az egyikükhöz és megöleli. Ezután mindenki üdvözli őket. Obi-Wan megdícséri Anakint és pár jótanáccsal látja el. A kép újra Coruscanton, Palpatine és a két Jedi menekül, de egy csapdába, mert megjelenik Grievous tábornok. A két Jedi nem bír vele, mikor szétbontja két kezét négyre. Shaak Ti érzi, hogy baj van és odafut, de sajnos későn. A két Jedi meghalt és Shaak Ti-t is hatástalanítja Grievous. Mace még megpróbálja elkapni a tábornokot és az Erő segítségével összeroppantja gép tüdejét, de ennél többet nem tud tenni. Ezután a Jedikhez fut és ledöbbenve látja, hogy csak Shaak Ti maradt életben. Később járunk, Anakin a kezét teszi helyre, Obi-Wan pedig oktatja. Hirtelen üzenet érkezik Mace Windutól, aki elmondja a jelenlegi állást. Anakin felpattan és kiadja a parancsot a klónkatonáknak. Coruscant űrjét látjuk, amint távolodunk a bolygótól, egy ismerős Star Wars zene szólal meg és elsötétül a kép. Innentől következik a Star Wars III. része...